法律分析：地区不同: 区级医保的医保卡只可以在本区医保定点医院刷卡治疗,而市级医保的医保卡可以在全市的医保定点医院刷卡治疗。
报销比例不同: 通常情况下区级医保报销比例比较高,而市级医保的报销比例就比区级医保低一些。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》 第三十条 下列医疗费用不纳入基本医疗保险基金支付范围：
(一)应当从工伤保险基金中支付的;
(二)应当由第三人负担的;
(三)应当由公共卫生负担的;
(四)在境外就医的。
医疗费用依法应当由第三人负担，第三人不支付或者无法确定第三人的，由基本医疗保险基金先行支付。基本医疗保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。