蜂毒对革兰阳性和阴性细菌皆有抑制和杀灭作用，但对上述两类细菌的作用强度不同，对革兰阳性菌的抑制浓度为12.5~25μg/mL，对革兰阴性菌则为1~10mg/mL，对革兰阳性菌的作用比对革兰阴性菌的作用强100倍。关于蜂毒的抗菌成分至今尚未进行认真研究。据报道蜂毒肽有明显的抗菌作用，证明其对结核杆菌、伤寒杆菌、链球菌、枯草杆菌等均有抗菌作用，并发现当给豚鼠皮下注射蜂毒肽
0.11~2.2mg时，对豚鼠的实验性伤寒有治疗作用。蜂毒肽对革兰阳性细菌的抗菌作用强度为1mg，等于0.1~93u青霉素。此外，实验已证明，蜂毒可增强磺胺和青霉素的作用，虽然蜂毒有明显的抗菌作用，但至今尚未受到应有的重视，更未被广泛用于临床治疗。