法律分析：
企业在办理增值税纳税申报时，直接按销售额申报，不需要通过《增值税纳税申报表附列资料（三）（服务、不动产和无形资产扣除项目明细）》填写扣除额。
法律依据：
国家税务总局《关于跨境应税行为免税备案等增值税问题的公告》 第二条 纳税人以承运人身份与托运人签订运输服务合同，收取运费并承担承运人责任，然后委托实际承运人完成全部或部分运输服务时，自行采购并交给实际承运人使用的成品油和支付的道路、桥、闸通行费，同时符合下列条件的，其进项税额准予从销项税额中抵扣：
（一）成品油和道路、桥、闸通行费，应用于纳税人委托实际承运人完成的运输服务；
（二）取得的增值税扣税凭证符合现行规定。
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