员工与公司纠纷找什么部门

可以去劳动局申诉或者仲裁。劳动仲裁是指由劳动争议仲裁委员会对当事人申请仲裁的劳动争议居中公断与裁决。在我国，劳动仲裁是劳动争议当事人向人民提起诉讼的必经程序。按照《劳动争议调解仲裁法》规定，提起劳动仲裁的一方应在劳动争议发生之日起一年内向劳动争议仲裁委员会提出书面申请。除非当事人是因不可抗力或有其他正当理由，否则超过法律规定的申请仲裁时效的，仲裁委员会不予受理。
1、劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受仲裁时效期间的；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。在诸多劳动争议中，劳动关系的终止时间对案件能否进入实体审理起到了重要作用。因此无论是用人单位还是劳动者在应当劳动争议时，在劳动关系的终止证据或质证观点上一定要有相应的准备。
2、劳动仲裁委员会原则上不应当主动审核劳动仲裁时效的问题。因为仲裁时效适用的是时效规则，且属于不告不理的程序性问题。在对方当事人未当庭提及仲裁时效的情况下，劳动仲裁委员会不应当主动审核该问题。
法律依据：
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》
第二条_谢嗣窆埠凸衬诘挠萌说ノ挥肜投叻⑸南铝欣投椋视帽痉ǎ
(一)因确认劳动关系发生的争议;
(二)因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议;
(三)因除名、辞退和辞职、离职发生的争议;
(四)因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议;
(五)因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议;
(六)法律、法规规定的其他劳动争议。
第五条_⑸投椋笔氯瞬辉感獭⑿滩怀苫蛘叽锍珊徒庑楹蟛宦男械模梢韵虻鹘庾橹昵氲鹘;不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁;对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民提起诉讼。