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1型HIV感染多重PCR检测方法的建立及临床应用

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2010正 l2月 首都医科大学学报 Journal of Capital Medical University Dec.2010 第31卷 第6期 V01.31 No.6 [doi:10.3969/j.issn.1006-7795.2010.06.001] ・HIV/AIDS基础与临床研究进展・ 1型HIV感染多重PCR检测方法的建立及临床应用 代丽丽 陈德喜 石 英 魏飞力 刘志英 张洪海 吴亚松 梁连春 吴 昊 张彤 (首都医科大学附属北京佑安医院感染中心) 【摘要】 目的建立检测人免疫缺陷病毒1型(HIV.1)的多重巢式PCR(nPCR)和多重反转录PCR(RT—PCR)方法。将其与已 经上市的NASBA法试剂盒进行检测敏感性比较;探讨血浆RNA水平对PCR检测敏感性的影响;评价该方法用于我国HIV一1感 染者诊断的价值。方法针对HIV一1的gag、pol和go41区设计3套引物,建立检测HIV DNA的多重nPCR和检测HIV RNA的 多重RT—PCR方法;分别以建立的PCR方法和NASBA法对119例HIV阳性患者进行检测,比较2者的检测敏感性;将患者分为 不同的病毒载量组,比较PCR方法在各组患者中的检测敏感性差异;使用建立的PCR方法对l0例可疑急性感染者进行检测;扩 增HIV.1膜区c2.c3段,对nPCR检测阳性的43例DNA样本进行亚型鉴定。结果多重nPCR的检测敏感度为97.5%(116/ 119),多重RT.PCR的敏感度为78.2%(93/119),2者的特异度均为100%(50/50),多重nPCR和多重RT—PCR的阳性预测值分 别为97.5%(116/119)和78.2%(93/119),阴性预测值均为100%(50/50),准确性分别为98.2%和84.6%。经比较,多重 nPCR和多重RT.PCR的检测敏感度都高于NASBA法。在病毒载量<10 copy/mL的患者,nPCR的检测敏感性高于RT—PCR,在 病毒载量在(10 ~l0 )copy/mL的患者及病毒载量≥10 copy/mL的患者,2者的敏感性比较相近,均接近100%;检测的lO例可 疑急性感染者中,有5例患者的nPCR和RT.PCR检测结果阳性,抗体在随访过程中阳转,证实为HIV急性感染者;检测的43例 DNA样本分属于B’亚型(37例),AE亚型(5例)和BC亚型(1例)。结论本课题组建立的PCR检测方法可以对我国主要流 行的B’、AE和Bc亚型病毒株得到很好的扩增效果;nPCR的检测敏感性受血浆RNA水平的影响相对较小,RT—PCR的检测敏感 性受血浆RNA水平的影响相对较大;PCR方法可以用于HIV急性感染者的早期诊断。 【关键词】人类免疫缺陷病毒;核酸检测;聚合酶链式反应;诊断 【中图分类号】R466.6 Establishment and Clinical Application of a Multiple Nested Polymerase Chain Reaction for Diagnosis of HIV-1 Infection DAI Li—li,CHEN De—xi,SHI ring,WEI Fei—li,LIU Zhi—ying,ZHANG Hong—hai,WU Ya-song,LIANG Lian・ chun,WU Hao,ZHANG Tong (Department ofInfectious Disease,Beijing Youan Hospital, 【ABsTRAcT】 objective To establish a multiple nested polymerase chain reaction(nPCR)and RT—PcR diagnosis assay system for human immunodeficiency virus.1(HIV.1)and to compare the sensitivity.speciifcity and other features of the method with those of a marketed assay.nucleic acid sequence.based ampliifcation(NASBA).Methotis The authors established an nPCR for detection of HIV DNA and RT-PCR f0r HⅣRNA detection system with three sets of primers which traget gag,pol and gp4l distircts in HIV-1 gene.A totl of l al9 HIV seropositive patients were tested by the PCR methods and NASBA separately.the sensitivitv was compared.The sensitivity of PCR detection in patients with diferent viral load were compared.Ten cases of suspected acute infeetion patients were tested by using tIle estblaished PCR methods.The C2.C3 distictr in HIV.1 membrane was ampliifed in 43 positive DNA to identify their subtype. Results Sensitivity of nPCR was 97.5%(116/119).Sensitivity of RT.PCR was 78.2%(93/119).Speciifcities of both assay systems were l0o%(5O/50).The positive predictive values are 97.5%(116/119)and 78.2%(93/119)respectively,and the negative predictive values of both were 10o%(50/5O).The accuracies were 98.2%and 84.6%.The nPCR assay systems showed higher sensitivity than NASBA(97.5%琊73.1%).111e sensitivity of nPCR was markedly higher than that of RT.PCT in patients with viral load <10 copy/mL.but the sensitivities of nPCR and RT—PCT were close to each other(nearly 100%)in patients with viral load 10 一10 copy/mL and≥10 copy/mL viral load.Five of the 10 cases of suspected acute infection were tested positive by the PCR.and had a sempositive conversion afterwards during the follow up.therefore they were confirmed to have acute HIV infeetion.The 43 DNA samples 基金项目:国家重点基础研究发展计划(2006CB504201),北京市科委科技计划重大项目(D0906003040591),Supported by National Basic Research Program of China(2006CB51M201)and Major Projects of Beijing Municipal Science&Technology Commission(D0906003040591) ¥Corresponding author,E-mail:ztdoc@yahoo.com.cn 688 首都医科大学学报 第3l卷 belong to subtype B’(37cases),AE subtype(5 cases)and BC subtype(1 case).Conclusion The established PCR detective methods were highly effective in detection of HIV subtypes B’,AE and BC,and showed a higher detective sensitivity than NASBA.The plasma RNA level has smaller influence on the sensitivity of nPCR than on RT-PCR.The HIV PCR diagnostic assay Call be used for early diagnosis of HIV acute infection. 【KEY WORDS】human immunodeficiency virus(HIV);nucleic acid test;polymerase chain reaction(PCR);diagnosis assay 聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)方 来自于河南省有偿献血人群),性途径感染者77例 法具有敏感、特异、简便、经济的特点,很早就有人尝 (占总数的51.3%,包括北京地区同性恋感染者67例 试将PCR技术应用于HIV感染的诊断,并取得了良 及各地散发异性性途径感染者l0例),静脉吸毒感染 好的效果¨ 。但是,由于HIV的高变异性,单套引 者1例(0.7%,来自于地区);其中34例患者正 物系统很难获得理想的检测敏感度和特异度 ,而 在接受抗病毒治疗(22.4%)。 多套引物联合检测的PCR方法,由于各系统的反应 2)阴性对照50例:根据目前的HIV感染实验室 条件和参数不同,操作相对复杂 j。本研究根据我国 排除标准,选取2006年6月间于首都医科大学附属 HIV流行特点,针对HIV gag、pol、gp4l区设计了能覆 北京佑安医院门诊就诊的2次HIV抗体初筛试验阴 盖我国主要HIV流行株的3套引物,建立检测病毒核 性者50例(年龄l9~55岁)作为阴性对照,其中包括 酸RNA、前病毒DNA的多重巢式nPCR和多重RT— HBV感染者l0例,HCV感染者l0例。 PCR检测方法,在保证了检测敏感性的基础上大大的 3)可疑急性感染者10例:无明确的HIV感染史。 (NASBA法),2例患者的病毒载量阳性,WB结果可疑。 1.2主要试剂和仪器 简化了操作程序,减少了检测成本和污染的机会,并 其中8例患者的抗体检测结果阴性而病毒载量结果阳性 对其进行临床应用研究。 1材料和方法 1.1标本组成 DNA、RNA提取试剂盒和胶回收试剂盒均购于德 国Qiagen公司,Tag酶、Takara one step RNA PCR Kit 1)HIV阳性患者150人:选取2006年5月~ (AMV)试剂购自大连宝生物工程有限公司,以法国 oMerirux公司的NucliSens HIV-1 QT试剂盒进行 2007年9月间在首都医科大学附属北京佑安医院门 Bi诊及住院的HIV阳性患者150例。根据目前的HIV NASBA法病毒载量检测(临界值为25 copy/mL,线性 感染实验室诊断标准,所有患者的HIV抗体初筛 检测范围51~5 390 000 copy/mL),PCR仪型号为 (EHSA法,Virpstika HIV UniforiB I1 plusO,Organon GeneAmp PCR system9700。 Teknika,Netherlands;HIV1+2抗体诊断试剂盒,北京 1.3建立HIV-1 PCR检测方法 金豪制药有限公司)及确认试验[免疫印迹(Western 1)引物的设计和选择:分别针对HIV-1的gag、 blotting),HIV blot 2.2,新加坡Genelab Technologies pol和go41区设计3套引物,建立检测HIV DNA的巢 公司,中国CDC]阳性。其中,男85例,女65例,年龄 式PCR(nPCR)和检测HIV RNA的反转录PCR(RT— l3 59岁;输血感染者72例(占总数的48.O%,主要PCR)方法。各引物序列见表1。 表1用于PCR扩增的三套引物 Tab.1 Thlree sets of primers used in the PCRs R=A 01e G:the primers with}magkeris ow/l designed 第6期 代丽丽等:1型HIV感染多重PCR检测方法的建立及临床应用 689 2)标本准备:取静脉血5 mL乙二胺四乙酸(ED— 条件。 TA)抗凝,4 h内离心,留取浓集白细胞层和血浆,按 照操作说明书提取DNA和病毒RNA,分装后冻存。 7)建立多重nPCR和多重RT—PCR检测方法:在 已经建立的nPCR和RT.PCR反应体系中同时加入3 3)建立检测前病毒DNA的nPCR方法:第1轮 套系统的上、下游引物,并减少相应量的无菌去离子 xL;去掉pol系统的内侧上 PCR体系:10×Buffer 2.5 ttL,25 mmol/L MgC1,2.0 水,使反应终体积仍为25 iL,2.5 mmol/L dNTP 2.0 tzL,5 U/ixl Tag酶0.125 游引物RAR1032,将其改为半nPCR,扩增片段变为 L,20 mmol/L上、下游引物各0.5 IxL,模板(DNA提 274 bp,反应条件不变;根据扩增效果适当调整3套引 取液)5 L,以无菌去离子水将反应终体积调整到 物的浓度。产物检测方法同前,如果出现154 bp 25 L。第1轮反应条件:94 oC 5 min,55℃1 rain, 72 cI=2 min(预循环),94 oC 30 s,55 oC 30 s,72 oC 1 min(30个循环),72 c《=10 rain。第2轮PCR体系:将 第1轮反应产物1 IxL作为模板,同样以无菌去离子 水将反应终体积调整到25 ,其余反应参数不变。 第2轮PCR条件:94 cI=2 rain,55℃50 S,72 oC 90 S (预循环),94 30 S,55℃30 S,72 oC 1 min(30个循 环),72℃10 min。每次检测同时设置阴、阳性对照 及空白对照。 4)建立检测血浆HIV RNA的反转录PCR(RT— PCR)方法:反转录反应体系和反应条件参照TaKaRa 一步法反转录试剂盒说明书:10×Buffer 2.5 ttL,25 mmo ̄L MgCl2 5 L,10 mmol/L dNTP 2.5 txL,5 U/ L Tag酶0.5 L,20 mmolZL上游引物0.5 L,20 mmol// L下游引物0.5 ixL,RNA提取液10 L,40 U/ L RNA酶抑制剂0.5 trL,5 U/ L AMV反转录酶0.5 L,以无菌去离子水将反应调整到25 L终体积。反 应条件:50 oC 30 min,94℃2 min(预变性),94 oC 30 S,55 oC 30 S,72 oC 90 S(35个循环),72℃10 min。反 转录后的nPCR体系、反应条件同前面建立的nPCR 方法的第2轮反应。每次检测同时设置阴、阳性对照 及空白对照。 5)产物检测及结果判读:取第2轮PCR反应产 物9 IxL加1 IxL 10×buffer,以3%琼脂糖凝胶、120 V 电泳15 rain后,紫外透射成像仪下观察结果。在阴阳 性对照结果正常的情况下,与DNA标准带相比,出现 相应大小的扩增片段判为阳性,否则为阴性。gag、 pol、gp41共3个系统的目的片段大小分别是154、170 和402 bp。 6)反应参数的优化:以HIV阳性的标本分别在 Mg”浓度0.5、1、1.5、2、2.5、3、3.5、4、4.5、5 mmo ̄L 和50℃、55℃、60 3个退火温度下进行PCR扩增, 确定各系统的最佳反应条件。在此基础上,选择3套 引物系统都能得到较好扩增的条件作为共同的反应 (gag)、274 bp(po1)或402 bp(gp41)大小的扩增片段 中的任意一个即判为阳性,3个片段全部阴性即判为 阴性。 1.4建立的多重PCR方法的临床应用研究 1)与金标准方法的比较:分别以建立的多重 nPCR和RT.PCR方法对150例阳性患者及50例阴性 患者进行检测,以ELISA/Western blotting相结合的抗 体检测结果为金标准,计算所建立的多重PCR方法 的检测敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和准 确性。 2)与NASBA法试剂盒进行检测敏感性比较:在 上述150例HIV阳性患者中有119例患者自愿进行 了病毒载量检测(NASBA法试剂盒),其中包括了34 例正在接受抗病毒治疗的患者。如果NASBA的检测 结果为<最低检测下限(1owest detection level,LDL) 判为阴性,否则判为阳性,计算该方法的检测敏感性。 同时以建立的多重nPCR和多重RT—PCR方法对 NASBA法检测的同份血标本进行检测,计算各自的 检测敏感性,并分别与NASBA法的检测敏感性进行 比较。 3)比较2种多重PCR检测方法在不同病毒载量 患者中的检测敏感性:依据NASBA检测结果,将119 例患者分为病毒载量阴性组和病毒载量阳性组,比较 nPCR和RT—PCR方法在2组患者中的检测敏感性是 否存在差异;并进一步将患者分为<LDL、<log3(包 含<LDL组的样本)、log3一l0g4和>log4病毒载量由 低到高的4个组,平行比较多重nPCR和RT PCR 2 种方法在各组患者间的敏感性差异。 4)PCR检测准确性判断:以建立的多重nPCR与 RT-PCR方法对l0例可疑急性感染者进行检测,随访 其抗体检测的结果,判断PCR检测的准确性。 5)对部分PCR阳性样本进行亚型鉴定:按照标 本编号顺序采取隔2选1的方法选择检测阳性的 DNA标本5O份,以HIV一1env区c2.C3段特异引物 第31卷 9+50)]。检测结果见表 (ED5/EDI2,ED31/ED33)进行nPCR扩增。最终有 和84.6%[(93+50)/(1l3,多重nPCR和多重RT—PCR的扩增电泳图见图l。 43份样本扩增出目标片段(其中包括河南有偿输血 2、感染者32份,北京同性恋感染者11份)。扩增产物 经回收、纯化后测序,通过Bioedit、Mega软件与标准 表2多重nPCR与ELISA/Western blotting相结合 的抗体检测方法(血清学方法)比较 Tab.2 Comparison of mulitple nPCR and ELISA/ 亚型序列进行比对,计算基因离散率,构建系统化树, 确定标本序列的亚型。 Western bloting t(case) 2 结果 2.1多重nPCR和多重RT-PCR检测结果 以ELISA/Western blotting相结合的抗体检测结 果(血清学方法)为金标准,多重nPCR的检测敏感度 为97.5%(1 16/119),多重RT—PCR的敏感度为 78.2%(93/119)。2种方法对50份阴性标本的检测 结果全部为阴性,特异度100%(50/50)。多重nPCR 表3 多重RT.PCR与ELISA/Western blotting相结合 的抗体检测方法(血清学方法)比较 Tab.3 Comparison of multiple RT-PCR and ELISA/Western blotting (case) 和多重RT.PCR的阳性预测值分别为97.5%(1 16/ 119)和78.2%(93/119),阴性预测值均为100%(50/ 50),准确性分别为98.2%[(116+50)/(1l9+50)] M 1 2 3 4 500bp 250 bp 500 bp 250bp 100 bp 100bp B 图1 多重nPCR扩增电泳图与多重RT-PCR扩增电泳图 Fig.1 Amplification results of muliplte nPCR and RT・PCR A:the ampliicatfion results of multiple nPCR;B:the results of multiple RT-PCR;M:marker 1:positive case(ym-19);2:positive control;3:negative control;4:blank contro1. 2.2 与NASBA法试剂盒的检测敏感度比较 载量的增高而增高,但是在低病毒载量组(<LDL组 以ELISA/Westem blotting相结合的抗体检测方 和<log3组),nPCR的检测敏感性要高于RT.PCR。 法(血清学方法)为金标准,NASBA法对119例阳性 在病毒载量高于10 copy/mL的患者,两者的检测敏 患者的检测敏感度为73.1%(87/119),多重nPCR的 感性则十分接近。 检测敏感度为97.5%(116/119),多重RT-PCR的检 2.4 10例可疑急性感染者检测结果 测敏感度为78.2%(93/119)。 lO例可疑急性感染者中,有5例患者的nPCR和 2.3 nPCR与RT-PCR方法之间的检测敏感性比较 RT—PCR检测结果阳性,抗体在随访过程中阳转,证实 在平行检测的119名阳性患者中,nPCR和RT. 为HIV急性感染者;另外5例患者的PCR检测阴性, PCR的检测敏感性分别为97.5%(116/119)和 抗体随访半年为阴性,除外了HIV感染。除外感染的 78.2%(93/119)。进一步分组比较可以看出,两者的 5例患者的NASBA法病毒载量检测值均<10 copy/ 差异主要表现在对低病毒载量患者的检测能力不同 mL(表5)。 (表4)。nPCR和RT—PCR的检测敏感性都随着病毒 第6期 代丽丽等:1型HIV感染多重PCR检测方法的建立及临床应用 表4 nPCR和RT.PCR在不同病毒载量患者的 检测敏感性比较 Tab.4 Comparison of sensitivity of nPCR and RT-PCR in cases with diferent viral load 2.5 43例阳性样本的亚型鉴定结果 来自于河南省有偿献血人群的32个毒株均为泰 国B亚型,与国际标准株间的基因离散率为(8.4± 0.7)%;而来自于北京同性恋人群的11份标本则分属 于泰国B亚型(5份)、AE亚型(5份)和BC亚型(1 份)。其与各国际标准株问的基因离散率分别为16%、 6.8%和7.4%。所形成的系统进化树见图2,3。 3讨论 LDL:lowest detection level HIV感染及其所引起的艾滋病是高度依赖实验 表5 10例可疑急性感染者PCR检测结果及抗体随访结果 Tab.5 PCR detection results and antibody detection in 10 suspected cases with acute HIV infection “一”:Negative;“+”:Positive;“±”:Suspicious;“\”:Missing;‘‘Y”:yes;“N”:not 丽 图2 32例河南省有偿献血感染者体内HIV一1毒株的系统进化树 Fig.2 The phylogenetic tree of 32 blood donors from Henan province 首都医科大学学报 第31卷 homo4 homolO homo9 homo7 B.TH.90.BK132 ACC AYl73951 B.US.98.1058 l 1 ACC AY33l295 homol1 D.UG.94.94UGl14 ACC U88824 Al,KE.94.Q23 l 7 ACC AF004885 O2 AG.NG—IBNG ACC L39l06 G.BE.96.DRCBL ACC AF084936 J.SE.94.SE7022 ACC AF082395 F2.CM.02.02CM 0Ol6BY ACC AY37I158 07 BC.CN.97.CN54 ACC AX14977l O8 BC.CN.97.97CNGX6F ACC AY0087 1 5 homo6 C.ZA.04.SKl 64B l ACC AY772699 homo3 homo5 Ol AC.TH.90.CM240 ACC U5477 l homo8 homol homo2 H.BE.93.V199l ACC AFl90l27 K.CD.97.E0TB1 lC ACC AJ249235 O.SN.99.SEMP1300 ACC AJ302647 图3 11例北京同性恋感染者体内HIV-1毒株的系统进化树 Fig.3 The phylogenetic tree of 11 homosexuals from Beijing 本研究选择了分别针对HIV一1 gag、pol、gp41 3个 室诊断的传染性疾病。建立早期、准确、可靠的诊断 方法是及时治疗患者,防止疫情传播的关键所在。目 保守区段的敏感引物,建立了25 小体积的多重 前,血清学方法,即抗体检测,仍然是诊断HIV感染的 nPCR和RT.PCR检测方法,不仅大大地节省了成本, 主要方法。除此以外,核酸检测,包括血浆病毒RNA 还可以将除了Tag酶以外的整个反应体系都预先配 检测和前基因组DNA的检测,是目前HIV感染最重 制并分装冻存,统一进行PCR检测,从而达到简化操 要的辅助诊断手段。与抗体检测相比,核酸检测可以 作、减少污染的目的。 更早的获得阳性结果,从而大大地缩短“窗口期”,此 在本实验检测的150份阳性标本中,只有3份标 外还用于18个月内的婴儿及抗体检测结果“不确定” 本在3套引物系统的检测结果为阴性。这3例患者 等患者的检测 J。现有的核酸检测商品化试剂盒,包 均为男性同性恋感染者,正在接受抗病毒治疗,HIV 括RT.PCR、NASBA、bDNA等,都是HIV RNA的定量 RNA水平在NASBA的检测限以下。以HIV C2一C3区 检测试剂盒,检测成本高,需要专门的仪器、试剂,且 特异引物也未能扩增出阳性条带,因此未能做亚型鉴 在血浆RNA水平较低的患者(病 主要是针对欧美流行的B亚型设计的,对非B亚型的 定。有文献r 报道,检测能力相对较差,不适于在我国这样的发展中国家 毒载量低于10 copy/mL),不仅RT.PCR的检测敏感 性会显著下降,由于其前病毒DNA的含量较低, 推广。 既往的研究 .4 表明,利用PCR技术进行HIV的 nPCR的检测敏感度也会下降。本研究尝试将第2轮 核酸的定性检测不仅能够获得非常高的检测敏感性、 PCR反应的模板量增加到5 ,结果其中的2例可以 特异性,而且不需要昂贵的仪器、设备,价格低廉,便 得到阳性结果(1份标本gp41系统阳性,另外1份标 于操作。然而,长期以来直接扩增PCR技术在 本的pol和gp41系统阳性)。因而猜测“前病毒DNA HIV诊断中广泛应用的原因主要有以下几个:①由于 水平过低”是这2例样本nPCR检测阴性的原因,而  HIV的高变异性,单一引物PCR很难获得理想的敏感 另1例样本未得到阳性结果。度_6 ;②多套引物联合检测的巢式PCR方法具有更 NASBA法是一种由一对gag区引物引导的特异 高的检测敏感度、特异度,但同时也增加了操作步骤, 性核酸序列扩增技术,是目前应用最为广泛的HIV核 增加了检测成本和污染概率;③由于PCR的高灵敏 酸定量检测方法之一。本实验所建立的PCR检测方 法表现出比NueliSens。HIV一1 QT更高的检测敏感性, 度,在操作过程中容易污染,造成假阳性。 第6期 代丽丽等:1型HI ̄感染多重PCR检测方法的建立及临床应用 可能的原因有:①NucliSens。HIV.1 QT所公布的 们的前病毒DNA储存库仍然存在。 LOD(1imits of detection,检测限)值是以1 mL样本量 在HIV感染后的4~11 d,病毒血症出现,并迅速 进行研究的结果。通常所使用的100~200 L血浆 达到很高的水平(通常在10 copy/mL左右)。核酸 V感染的主要手段,平均比抗体检 量,虽然是在该试剂盒所允许的样本量范围内(10~2 检测是早期诊断HImL),但是,对一些极低病毒载量样本的检测能力会 测提早25 d。抗体检测阴性或不确定,而病毒载量值 有一定下降 8 ;②NucliSens。HIV.1 QT只包含一对 较低(<10 copy/mL)的情况有2种可能:①污染造 针对HIV一1 gag区的引物,如果发生该段序列的变异, 成的假阳性;②急性感染后期,血浆病毒载量已经降 将会直接影响其检测敏感性。我们设计的PCR方法 至到了调定点。如果抗体在随访过程阳转,则可以确 联合应用了针对gag、pol、ge41 3个保守区段的引物 系统,大大减低了由于基因变异造成的假阴性率;③ NucliSens。HIV一1 QT主要是根据欧美流行的B亚型 设计的,非B亚型的检测能力相对较差 J。本研究设 计的PCR方法包含了能覆盖我国各主要流行株亚型 的3套引物系统,很大程度上可以避免由于亚型不符 而造成的假阴性;④nPCR方法检测的是整合在宿主 基因组的前病毒DNA,即便在血浆RNA阴性的患者 仍然可以获得阳性结果。 虽然理论上,PCR可以检测出低至一个拷贝的核 酸序列,但一般认为,对病毒载量低于10 copy/mL的 患者,RT-PCR的检测敏感性会减低。在我们的研究 中,RT—PCR在病毒载量大于10 copy/mL的患者中具 有非常高的检测敏感性,而在病毒载量阴性患者中的 检测敏感性则降低。这主要因为,在血浆RNA含量 过低的情况下,PCR体系中所加入的少量模板可能恰 好没有包含目的核酸分子,或扩增的产物量没能达到 可以检测的水平。 nPCR方法检测的是整合到宿主基因组中的前病 毒DNA,其含量受血浆RNA水平的影响相对较小。 然而,有研究_】 表明,前病毒DNA的含量与血浆 RNA水平间仍存在着一定的相关性:在血浆RNA水 平较低的患者,其前病毒DNA的含量也较低。Shan. non M M等 u建立的HIV DNA PCR扩增体系对高病 毒载量组的检测敏感性高于对低病毒载量组的检测 敏感性。Francesca V等 还观察到HIV DNA在 HAART过程中会有缓慢下降,并提出可能与病毒储 存库的消耗有关。 在本研究中,检测HIV前病毒DNA的nPCR方 法在血浆病毒载量阴性患者中的检测敏感性也有下 降,但远高于RT.PCR方法。那些血浆病毒被长期抑 制的HAART患者(有4例患者的病毒载量已经阴转 24个月以上),虽然RT-PCR未能检测到血浆HIV RNA的存在,但是nPCR仍能获得阳性结果,说明他 定是急性感染。核酸PCR检测方法具有简单、快速、 经济等特点,可以帮助尽早的确定诊断。 根据“全国艾滋病毒分子流行病学调查”项目的研 究结果,BC、B’、和AE亚型是我国流行的最主要亚型, 占总数的94.85%。我们检测的样本中绝大部分都属 于这些亚型,说明我们建立的PCR检测体系能够对我 国这些主要的病毒亚型达到很高的检测敏感性。 目前,在欧美等发达国家,HIV病毒核酸定量检 测试剂盒已经被广泛应用到血液筛查等领域,但是对 大多数发展中国家而言,建立一套简便、经济、敏感、 特异的HIV PCR定性检测方法则意义非凡。本研究 不仅建立了一套经济、实用的HIV PCR检测方法,而 且对nPCR和RT—PCR的检测敏感性及其受血浆RNA 水平的影响程度等问题都做了比较研究,为其进一步 临床应用奠定基础。 4参考文献 [1]0u c Y,Kwok S,Mitchell S W,et a1.DNA amplification for direct detection of HIV.1 in DNA of peripheral blood mononuclear cells[J].Science,1988,239:295-297. 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[5] Constantine N T,Zink H.HIV testing technologies after two decades of evolution[J].Indian J Med Res,2005, 121:519-538. 694 首都医科大学学报 第31卷 《首都医科大学学报》获“第三届中国高校优秀科技期刊奖” 为了不断促进高校科技期刊的发展,提高期刊的学术质量和编辑出版质量,扩大我国高校科技期刊在国内 外的影响,对科技期刊在科学活动和文献交流中所起的作用及其质量作出客观、全面的评价,在教育部科技司 的领导下,中国高等学校自然科学学报研究会常务理事会进行了“第三届中国高校精品・优秀・特色科技期 刊”的评比。《首都医科大学学报》在评比中获“第三届中国高校优秀科技期刊奖”。 “第三届中国高校优秀科技期刊”的评比采用中国学术期刊(光盘版)电子杂志社编写的《中国学术期刊综合 引证报告》的评价数据,依据学术(技术)质量评比标准和编辑出版质量评比标准给参评期刊打分并排序。学术评 价指标包括:1)离均差率;2)总被引频次;3)影响因子;4)他引总引比;5)基金论文比;6)平均引文数;7)论文下载 率;8)被国内外重要检索系统收录数;9)互引指标等。编辑出版质量评价包括编校质量和出版质量。 这是《首都医科大学学报》继2006年获“首届中国高校优秀科技期刊奖”后再次获得该项殊荣。这既是对 《首都医科大学学报》以往工作的肯定,也是对今后工作的鞭策,《首都医科大学学报》工作人员将再接再励,积 极探索、改革创新,充分发掘并发挥好高校的办刊优势,不断提升《学报》的影响力和竞争力,为高校教学、科研 和社会服务做出新的贡献,也争取在期刊的学术水平和编校质量上再上一个新的台阶。 

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