国际检验医学杂志2013年3月第34卷第6期Int J LabMed,March 2013,Vo1.34,No.6 ・ 7O7 ・ NALC—NaOH前处理法具有耐受性。 of the century[J].Medicine(Baltimore),2009,88(4):250 261. 综上所述,当痰液等被杂菌污染的标本直接接种在非选择 性培养基上时,由于其中常常会有大量的正常菌群等,致使不 易检出可能存在的诺卡菌 ]。因此,对于可疑为肺诺卡菌病 的患者,若能将痰标本经NALC—NaOH法消化处理后再接 种Do],将有利于诺卡菌的检出。 参考文献 [1] Martinez R,Reyes S,Men6ndez R.Pulmonary nocardiosis:risk factors,clinical features,diagnosis and prognosis[J].Curr Opin Pulm Med,2008,14(3):219-227. [5]中国防痨协会基础专业委员会编著.结核病诊断实验室检验规程 [M].北京:中国教育文化出版社,2006:30—35. [6]俞树荣.微生物学和微生物学检验[M].2版,北京:人民卫生出版 社,2002:271. [7]王敬萍,李宝兰,刘涌,等.原发性奴卡氏菌病l例[J].中国防痨 通讯,2004,26(2):128. [8]Murray PR,Niles AC,Heeren RL.Modified Thayer-Martin medi um for recovery of Nocardia species from contaminated specimens [J].J Clin Microbiol,1988,26(6):1219-1220. [9]吴立平,杨艺,刘婷.肺诺卡菌病1例[J].中国抗感染化疗杂志, 2005。5(2):117-118. 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[4]Minero MV,Marin M,Cercenado E,et a1.Nocardiosis at the turn ・检验技术与方法・ 单纯疱疹病毒核酸分型诊断方法的建立 支丽霞 ,赵云生 ,江秀娟。 (1.兰州市第二人民医院检验科,甘肃兰州730046;2.甘肃省定西市红十字会中心血站, 甘肃定西743000;3甘肃省肿瘤医院检验科,甘肃兰州730050) 摘 要:目的 应用荧光定量聚合酶链式反应(FQ PCR)技术,建立一种快速、灵敏度高、特异性强且可以定量分型检测单纯 疱疹病毒(HSV)的方法。方法根据单纯疱疹病毒糖蛋白B基因序列设计引物和探针,建立HSV1、2型检测的方法;构建标准 品进行定量分析,测试方法的灵敏度;检测相关的其它临床分离菌株和样本,测试方法的特异性。结果 检测HSV1、2的自建标 准品,检测下限分别可以到达300 copy/mL和400 copy/mI ,且标准曲线的相关系数均大于0.998。通过检测参考菌株和临床标 本,证明具有100 的特异度;且可以对HSV1、2分型。结论的临床使用价值。 本方法是一种快速、灵敏且准确的HSV分型检测方法,具有重要 关键词:单纯疱疹病毒属;核酸分型;PCR DOI:10.3969/j.issn.1673—4130.2013.06.034 文献标识码:A 文章编号:1673 4l3O(2O13)06—0707—02 单纯疱疹病毒(HsV)是人类病毒性疾病中常见的病原体 之一,根据抗原性不同,可分为HSV1和HSV2两种血清型。 两种血清型的临床表现不同,HSV1主要引起腰部以上,如眼、 均由兰州市第二人民医院检验科提供。 1.2试剂与仪器 QIAamp DNA Mini Kit和artus HSV一1/2 PCR Kit CE(德国Qiagen公司产品);pMD18-T载体(TAKA— RA公司产品);Wizard Plus SV Minipreps DNA纯化试剂盒 (Promega公司产品);TaqMan Universal PCR Master Mix 口、唇的皮肤黏膜以及中枢神经系统的感染,HSV2主要引起 生殖器部位的皮肤黏膜及新生儿感染,并与女性外阴癌和宫颈 癌的发生有关。HSV两种亚型感染的预后和处理方法不同, 因此对HSV感染进行早期诊断和分型具有重要的临床意义 (Applied Biosystems公司产品);DU730核酸蛋白分析仪(贝 克曼公司产品);ABI9700PCR扩增仪及ABI7500荧光定量 PCR仪(Applied Biosystems公司产品)。 1.3方法 和流行病学意义_】 3_。目前对单纯疱疹病毒性疾病的实验室诊 断主要以免疫学方法为主,检测的灵敏度和准确度不够理想。 而荧光定量PCR技术是目前较先进的分子生物学技术,具有 特异性强、灵敏度高且稳定性好等优点,另外荧光PCR仪可以 同时检测5种不同波长的荧光信号,可用于HSV的核酸分型 鉴定 。]。本研究拟利用多色实时荧光定量PCR技术在同一 1.3.1引物与探针设计根据GenBank中提供的HSV糖蛋 白B基因序列分别设计特异性检测HSV1和HSV2的引物和 探针。以HSV1的糖蛋白B基因(序列号:AF311740.1)和 HSV2的糖蛋白B基因(序列号:AF295528)为模板,使用 Primer Express 3.0软件设计引物和探针。最后将设计好的引 反应体系中建立一种对HSV1和HSV2型核酸分型准确、特 异、简便的鉴别诊断方法。 1材料与方法 物和探针序列在NCBI数据库中进行Blast比对,确定HSV1 或HSV2引物和探针的保守性。HSV1:上游引物HS1一F为 5,_AAG GTC ACC GAC ATG GTC ATG一3 ,下游引物HS1一R 为5._TCA CCG TCT TTG TTG GGA ACT一3 ,探针HS1~P 为5 一FAM—AAG CGC CGC AR(R—A/G)CAC CAA CTA CAC C—BHQ1—3 ;HSV2:上游引物HS2一F为5 一ACG GAA CAC AAG GCC AGA AA一3 ,下游引物HS2一R为5,_AGC 1.1 菌株与临床标本 标准菌株单纯疱疹病毒l型ATCC VR一1493和单纯疱疹病毒2型ATCC VR-540购自美国 ATCC公司。实验室分离菌株单纯疱疹病毒1型(4株)、单纯 疱疹病毒2型(10株)、淋球菌(3株)、沙眼衣原体(2株)、解脲 脲原体(2株)、白色念珠菌(1株)、巨细胞病毒(1株)、人乳头 瘤病毒阳性标本(HPV 6、l1、l6和18型各2例)、杜克雷氏杆 菌(1株)、阴道毛滴虫阳性标本(2株)和6o例生殖器疱疹标本 GGA GAG TAC CTG GCT TTG一3 ,探针HS2一P:5 HEX— CAA CAT GGT TCT GCG CAA GCG C—BHQ1—3 。引物和探 ・ 7O8 ・ 国际检验医学杂志2013年3月第34卷第6期Int J Lab Med,March 2013,V01.34,No.6 针由宝生物工程(大连)有限公司合成。 1.3.2 DNA提取菌株直接取200 L培养物用于DNA提 取;I临床标本处理方法为:往样本收集管中加入2 mL无菌生 理盐水,充分震荡洗涤棉拭子,然后将拭子靠管壁挤于丢弃,取 200 tA 液体用于DNA提取。所有菌株和临床标本均采用 QIAamp DNA Mini Kit按照产品说明书提取DNA。 1.3.3标准品的构建HSV1和HSV2标准株扩增的PCR 产物分别连接到pMD18一T载体上,测序正确的质粒分别作为 HSV1和HsV2的标准品。构建成功的载体使用DNA纯化 试剂盒进行纯化后,再采用DU730核酸蛋白分析仪测定质粒 的浓度,换算成拷贝数后,作为阳性标准品制作标准曲线。 I.3.4 反应体系的优化 反应体系的优化是在TaqMan通用 PCR反应体系基础上进行的,所有引物终浓度选择0.2 ̄mol/ I 至0.4/ ̄mol/I 范围内优化,所有探针终浓度选择0.1/ ̄mol/ I 至0.3“mol/I 范围内优化。HSV1和HSV2模板使用构建 的质粒标准品,包括HSV1和HSV2独立的和混合的两种类 型的模板,浓度选择100 000拷贝 反应体系和1 000拷贝/反 应体系两个梯度。 1.3.5 反应条件的选择 本研究采用两步法进行反应条件的 优化,其中主要是优化延伸加退火步骤的温度和时间,有3种 组合供选择:60 C,50 s;58 C,60 s和6O℃,60 s。 2 结 果 2.1最佳反应体系建立最终确定的反应体系中各成分的终 浓度为:HS1一F和HS1一R各0.3 tlmol/I ,HS2 F和HS2一R各 0.2 tool/L,HS1一P为0.1 mol/I ,HS2一P为0.2 mol/L。最 终确定的反应条件为:94℃,预变性10 minM5个循环包括:94 ℃,l5 s和60℃,50 s。 2.2 特异性 本试剂检测单纯疱疹病毒1型ATCC VR_ 1493、单纯疱疹病毒2型ATCC VR一540、单纯疱疹病毒l型(4 株)和单纯疱疹病毒2型(10株)均为阳性,且可以对两者分 型;参考菌株淋球菌、沙眼衣原体、解脲脲原体、白色念珠菌、巨 细胞病毒、人乳头瘤病毒阳性标本、杜克雷氏杆菌、阴道毛滴虫 阳性标本均为阴性。说明引物和探针的特异性好。 2.3 灵敏度及标准曲线HSV1的质粒标准品从3 000 000 拷贝/mI 按10倍梯度稀释至300 copy/mI ,均可以检出; HSV2的质粒标准品从4 000 000 copy/mL按lo倍梯度稀释 至400 copy/mI ,均可以检出;而且HSV1和HSV2同一梯度 的模板在同…管中进行扩增的。该方法对HSV1的检测范围 在30 000 copy/mI 到300 copy/mI 之间,且灵敏度达到3拷 贝 反应体系;该方法对HSV2的检测范围在40 000 copy/mL 到400 copy/mI 之间,且灵敏度达到4拷贝/反应体系;相互间 影响彼此的扩增。选择HSV1的5个浓度梯度的模板制作 的标准曲线,相关系数r 为0.998 9;选择HSV2的4个浓度 梯度的模板制作的标准曲线,相关系数r 为0.998 1;说明该 方法对HSV1和HSV2定量检测的标准曲线的线性较好。 HSV1的标准曲线的斜率为一3.98,HSV2的标准曲线的斜率 为一4.O8,斜率接近,说明两者的扩增效率基本一致。 2.4 60例临床样本的测试 对6O例生殖器疱疹临床标本同 时使用本试剂和artus HSV 1/2 PCR Kit CE(德国QIAGEN 公司产品)进行检测,对比检测结果表明两种试剂的阳性符合 率为100 ,两种试剂的阴性符合率也为1007o,所以,两种试 剂检测结果完全相符合。6o例样本中,HSV阴性的标本9例 (占1 5 ),HSV1阳性的3例(占5 ),HSV2阳性的8O ,未 检测到HSV1和HSV2同时感染的样本。对3例HSV1阳性 的PCR产物和随机抽取了1O例HSV2阳性的PCR产物送往 lnvitrogen上海公司进行测序,测序结果和GenBank中HSV 相关序列同源性大于99 ,证明检测结果正确。 3讨 论 病毒细胞分离培养是实验室诊断HSV感染最为敏感的 方法,且可以对分离株分型鉴定,但该方法对实验条件要求严 格,且成本高、操作繁琐、实验周期长,在临床应用有很大的局 限性,不易开展。HSV的血清学试验主要检测存在于血清中 的HSV抗原或特异性抗体,常用方法为EI ISA、间接免疫荧 光法和胶体金方法等。EI IsA检测HSV抗原具有方便、快 速、特异性较强等特点,对疱疹皮损的HSV抗原检出率较高, 但疱疹后期皮损的HsV抗原检出率较低。而血清HSV特异 性IgM和IgG抗体需要在感染后一定的时间产生,有可能出 现假阳性或假阴性,同时HSV感染所造成的临床症状各有 同,可能会产生误诊和误治 。PCR和ELISA检测单纯疱疹 病毒,两方法特异性完全一致,PCR检测阳性率高,比E1 ISA 敏感近2o倍 】。目前,国家食品药品监督管理局批准上市的 单纯疱疹病毒荧光PCR检测试剂盒有7个,其中检测HSV1 的有1个,检测HSV2的有6个,但未有HSV1、2同时检测或 分型检测的荧光PCR试剂盒得到批准上市,现有研究对 HSV1、2的PCR分型检测方法大多在2个反应管中进行,本 研究在同一反应管中利用多色荧光定量PCR技术建立的 HSV1和HSV2核酸分型诊断方法使实验操作更为简便。通 过检测标准菌株和临床标本,具有100 的特异度;通过检测 HSV1和HsV2的自建标准品,灵敏度分别可以到达300 cop y/mL和400 copy/mL,且标准曲线的相关系数均大于0.998; 整个实验过程在1个半小时内完成,不但可以对HSV定量,而 且可以对HSVl和HSV2分型,是一种快速、灵敏且准确的 HsV分型检测方法,具有重要的临床使用价值。 参考文献 [1]姬小薇,毛旭虎,邹全明.单纯疱疹病毒型特异性的鉴别诊断[J]. 国际检验医学杂志,2006,27(8):739 740. 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